Falcon Computing 在赛灵思开发者论坛面向从事混合云工作的软件开发者推出 FPGA 加速解决方案

由 judy 提交于周二, 27 十一月 2018 - 09:35

异构加速计算领域领导者 Falcon Computing 公司在 2018 年赛灵思开发者论坛 (XDF) 上推出运行在功能强大的新型赛灵思加速器卡 Alveo U200 上的 Merlin 编译器和 Falcon加速基因组学流水线。

Merlin 编译器让没有FPGA 专业技术的软件开发者也能获得赛灵思 FPGA 带来的优势，能为机器学习、金融、基因组学和数据分析等认知时代的应用提供高达 47 倍的加速。Falcon 加速基因组学流水线提供每天能分析 5 个完整基因组或 50 个全外显子组的业界标准 GATK 流水线。

Falcon 的这两款产品已运行在公有云上的赛灵思 FPGA 上，这些公有云包括 AWS、华为云和阿里巴巴云。今天推出之后，软件开发者和生物信息学家通过使用配备 Alveo U200 数据中心加速器卡的服务器，就能在本地数据中心上获得同样优势。

运行在赛灵思 FPGA 上的 MERLIN 加速

（与 16 核 CPU 对比，240X）
<center><img src="http://xilinx.eetrend.com/files-eetrend-xilinx/news/201811/13931-40913-…; alt=""></center>

Kmeans Black Scholes Asian Black Scholes European AES

机器学习金融金融加密

<div id="mytable">
<body>
FALCON 加速基因组学流水线 (**bleep**P) 与原始 GATK 对比
<table border="1">
<tbody>
<tr>
<td>平台</td>
<td>BWA
（秒）</td>
<td>MarkDup
（秒）</td>
<td>BQSR
（秒）</td>
<td>HTC
（秒）</td>
<td>总用时
（小时）</td>
<td>加速
（相对于 GATK）
<table>
<tbody>
<tr>
<td> GATK</td>
</tr>
</tbody>
</table>
GATK）</td>
</tr>
<tr>
<td>原始 GATK</td>
<td>33579</td>
<td>20222</td>
<td>9990</td>
<td>101418</td>
<td>49.61</td>
<td>1 倍</td>
</tr>
<tr>
<td>运行在 U200的 **bleep**P</td>
<td>7444</td>
<td>2154</td>
<td>4198</td>
<td>3557</td>
<td>4.82</td>
<td>10 倍</td>
</tr>
<tr>
<td>运行在 AWS的 **bleep**P</td>
<td>8768</td>
<td>2077</td>
<td>4477</td>
<td>4023</td>
<td>5.37</td>
<td>10 倍</td>
</tr>
</tbody>
</table>
</body>
</div>

Falcon Computing 产品与市场营销副总裁 Sunder Parameswaran 表示：“随着 Alveo U200 加速器卡的推出，赛灵思正在把媲美公共云 FPGA 加速性能的基本块向本地数据中心推广。开发认知时代应用的软件开发者渴望发挥 FPGA 的作用，但因缺乏硬件专业技术，面临重重困难。Merlin 编译器能为开发者提供按钮式自动化方法，即使完全不具备 FPGA 专业技术也能使用自己的 C/C++ 应用并提升应用性能。”

Parameswaran 说“这种加速优势也惠及我们自己的加速基因组学流水线。作为赛灵思的长期合作伙伴，我们得以尽早获取该技术并将我们的解决方案迁移到新型 U200 卡上，在原始 GATK 流水线基础上提速 10 倍。